Metabolomics Platform of CEBAS-CSIC
The Metabolomics Platform is an investigation unit in metabolomics created to offer services to different groups of investigation of CEBAS-CSIC and other public or private institutions which pretend deal with this kind of studies.
The Metabolomics Platform intends to offer a service and also participate actively in developing projects and experiments related to metabolomics proposed by the groups. That means that the collaboration must be as close as possible throughout every phase of the project (from the definition of the objectives to the processing and interpretation of the data) helping to obtain satisfactory, substantial and useful for the groups.
Plataforma Metabolómica de Alimentos Vegetales
Unión Europea. Proyecto cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional
The recent acquisition of the UPLC-QTOF 6550 I-Funnel and the impending incorporation of the equipment HPLC-QTOF-SPE-RMN allow an exploration of every analyte of low molecular weight (metabolites) which appear in different kinds of biofluids (e.g plasma and/or orine) or in human and animal tissues. Metabolics can be defined as the more emerging omic science which permits obtaining a metabolic profile of a complex biological sample through the combination of analytical techniques which generate a great amount of data and its multivariate statistical analysis. Metabolomics it leaves aside traditional and reductionist methods which focus on studying the effect of one component about a biological system.
Metabolomics permits the analysis of a great amount of metabolites in complex matrices such as biofluids and tissues in an automated and efficient manner. This analysis generates a profile of metabolites whose comparison, through multivariate statistical techniques which allow the identification of specific metabolic changes for different phenotypes subject of study. Among others, clinical applications of metabolomics, such as the discovery of biomarkers and consequently the early diagnosis of certain diseases, and how it is applied to the study of candidate molecules in the preclinical phase or the use of this technique in trials assessing the terapeutical efficacy.
The work plan for investigation in metabolomics, led or not, can be carried out through multiple techniques available in the Metabolomics Platform of the CEBAS-CSIC.
PERSONAL DEL SERVICIO DE METABOLÓMICA |
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Frutos Lisón, Mª Dolores | Contrato PTA | Ext -445326 | mdfrutos@cebas.csic.es |
Toledo Gil, Rosa | Contratada Proyecto | Ext -445326 | rtoledo@cebas.csic.es |
Vallejo Mellado, Fernando | Scientific Coordinator | Ext - 445374 |
metabolomica@cebas.csic.es fvallejo@cebas.csic.es |
Yuste Jiménez, José E. | Titulado Superior Espec | Ext -445326 |
jyuste@cebas.csic.es |
MUESTRAS ALIMENTARIAS
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
Vitamina C (Ac. Ascórbico) | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
Vitamina E y derivados | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
Compuestos fenólicos | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
Taurina | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
Amigdalina y Prunasina | Identificación y Cuantificación | UPLC-UV-QToF |
Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Se-(metil)-seleno-L-Cisteina (SeMC) | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
Alicina y derivados | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
Oleuropeína | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
Azúcares y ácidos orgánicos | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
Compuestos Orgánicos Volátiles (VOCs) | Identificación y Cuantificación | HS-GC-MS |
EXTRACTOS VEGETALES
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
Glucosinolatos (Alifáticos/Indólicos) (Consultar) | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
Compuestos Fenólicos | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
Vitamina C (Ac. Ascórbico) | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
Vitamina E y derivados | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
Amigdalina y Prunasina | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Alcaloides (Consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Glicoalcaloides (Consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Hormonas vegetales (IAA, SA, ABA, JA y GA3) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Lactonas Sesquiterpénicas | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Micotoxinas (Consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Polialcoholes (Sorbitol, Galactinol, myo-Inositol) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Azucares, ácidos orgánicos y nucleósidos | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Metabolítos Secundarios (consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Trans-Resveratrol | Identificación y Cuantificación | UPLC-UV-QToF |
Compuestos Orgánicos Volátiles (VOCs) | Identificación y Cuantificación | HS-GC-MS |
MUESTRAS BIOLÓGICAS (Plasma, Orina, cultivos "in vitro")
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
Vitamina C (Ac. Ascórbico) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Vitamina B y derivados | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Taurina | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Prostaglandinas (PGs) Consultar | Identificación y Cuantificación | UPLC-Triple Quadrupolo |
Micotoxinas (Consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
Lactulosa/Manitol | Identificación y Cuantificación | UPLC-Triple Quadrupolo |
Farmacología (Benzodiacepinas, Anfetaminas, Cannabinoides y derivados) | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
Eicosanoides (Ac. Grasos Poli-insaturados) Consultar | Identificación y Cuantificación | UPLC-Triple Quadrupolo |
Aminas Biogénicas (Consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
Ácidos Biliares (A consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
Ácidos Grasos de cadena corta (SCFA) | Identificación y Cuantificación | GC-MS |
MUESTRAS DE AGUA (EDAR, RIO, RIEGO)
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
Contaminación Fármacos Emergentes | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
Drogas de Abuso | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
ANÁLISIS METABOLÓMICO "NO DIRIGIDO" DE MUESTRAS BIOLÓGICAS Y EXTRACTOS VEGETALES
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
Estudios de Metabolómica “no dirigida” (Consultar) | Extracción de los datos crudos (Cromatogramas LC-MS) | UPLC-QToF (F.Scan y AutoMS/MS) |
ANÁLISIS DE ESPECTROSCOPÍA MEDIANTE 1H-RMN (EXTRACTOS VEGETALES, ALIMENTOS Y MUESTRAS BIOLÓGICAS)
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
Azúcares | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
Ácidos Orgánicos | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
Aminoácidos esenciales y derivados | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
Nucleótidos y derivados | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
Polialcoholes (Myo-inositol, Galactitol, Sorbitol, Glicerol) | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
Metabolitos secundarios (Consultar) | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
Osmolitos (Betaina, Colina, Sarcosina, EA, DMA) | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
Lignanos (SDG) | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
Hesperidina (Análisis del isómero S) | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
TARIFAS DEL SERVICIO DE METABOLÓMICA DEL CEBAS-CSIC | ||||
PLATAFORMAS ANALÍTICAS | CEBAS | CENTROS CSIC | OOPP | OTROS (EMPRESAS) |
UPLC-UV-QToF-MS (Agilet 6550 y maXis impact series de Bruker) | 40 | 46.92 | 60 | 120 |
UPLC-Triple Quadrupolo (Agilent 6460) | 40 | 46.92 | 60 | 120 |
UPLC-DAD-MS-Quadrupolo simple (Agilent) | 30 | 35.19 | 46 | 100 |
GC‐MS (GC‐8890 y MSD‐5977B Agilent) + Brazo de Gerstel | 40 | 46.92 | 60 | 120 |
RMN AVANCE III HD 500 MHz CryoProbe Prodigy BBO (Bruker) | 40 | 46.91 | 65 | 120 |
UPLC-UV-QToF-MS-SPE-NMR 'On-line' (Bruker) | 60 | 70.38 | 100 | 200 |
- Tarifas por muestra (Precio en euros)
- El precio no incluye la preparación de la muestra
- Precios sin IVA