Description of the Service

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The Metabolomics Platform is an investigation unit in metabolomics created to offer services to different groups of investigation of CEBAS-CSIC and other public or private institutions which pretend deal with this kind of studies.

The Metabolomics Platform intends to offer a service and also participate actively in developing projects and experiments related to metabolomics proposed by the groups. That means that the collaboration must be as close as possible throughout every phase of the project (from the definition of the objectives to the processing and interpretation of the data) helping to obtain satisfactory, substantial and useful for the groups.


Plataforma Metabolómica de Alimentos Vegetales
Unión Europea. Proyecto cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional

The recent acquisition of the UPLC-QTOF 6550 I-Funnel and the impending incorporation of the equipment HPLC-QTOF-SPE-RMN allow an exploration of every analyte of low molecular weight (metabolites) which appear in different kinds of biofluids (e.g plasma and/or orine) or in human and animal tissues. Metabolics can be defined as the more emerging omic science which permits obtaining a metabolic profile of a complex biological sample through the combination of analytical techniques which generate a great amount of data and its multivariate statistical analysis. Metabolomics it leaves aside traditional and reductionist methods which focus on studying the effect of one component about a biological system.

Metabolomics permits the analysis of a great amount of metabolites in complex matrices such as biofluids and tissues in an automated and efficient manner. This analysis generates a profile of metabolites whose comparison, through multivariate statistical techniques which allow the identification of specific metabolic changes for different phenotypes subject of study. Among others, clinical applications of metabolomics, such as the discovery of biomarkers and consequently the early diagnosis of certain diseases, and how it is applied to the study of candidate molecules in the preclinical phase or the use of this technique in trials assessing the terapeutical efficacy.

The work plan for investigation in metabolomics, led or not, can be carried out through multiple techniques available in the Metabolomics Platform of the CEBAS-CSIC.

PERSONAL DEL SERVICIO DE METABOLÓMICA
Vallejo Mellado, Fernando Téc. Espec. Grado Medio
metabolomica@cebas.csic.es
Yuste Jiménez, José E. Contrato Proyecto
Ext - 6326
jyuste@cebas.csic.es

MUESTRAS ALIMENTARIAS

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Vitamina C (AA/DHAA) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Vitamina E y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS
Compuestos fenólicos Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Taurina Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Amigdalina y Prunasina Identificación y Cuantificación UPLC-UV-QToF-MS
Aminoácidos (20 esenciales) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Se-(metil)-seleno-L-Cisteina (SeMC) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS
Alicina y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS
Azúcares y ácidos orgánicos Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS
Nucleosidos y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS

EXTRACTOS VEGETALES

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Glucosinolatos (Alifáticos/Indólicos) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Compuestos Fenólicos Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Vitamina C (AA/DHAA) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Vitamina E y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS
Amigdalina Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Isotiocianatos Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Aminoácidos (20 esenciales y 2 derivados) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Alcaloides (α-tomatina y tomatidina) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Alcaloides Tropánicos y Pirrolidínicos Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS
Hormonas (Melatonina, IAA, ABA y derivados) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS
Polialcoholes (Sorbitol, Galactinol, myo-Inositol) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS
Azucares, ácidos orgánicos y nucleósidos Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS
Metabolítos Secundarios (consultar) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS

MUESTRAS BIOLÓGICAS (Plasma, Orina, cultivos "in vitro")

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Vitamina C (AA/DHAA) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Vitamina B6 y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS
Taurina Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Aminoácidos (20 esenciales y 2 derivados) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Citosinas ADN Hidroximetiladas Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Bases Púricas y Pirimidínicas Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS
Prostaglandinas (PGs) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
SAMe/SAH Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo/ UPLC-QToF-MS
Lactulosa/Manitol Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Nucleósidos/Nucleótidos Identificación y Cuantificación UPLC-UV-QToF-MS
Toxicología (Alcaloides, Benzodiacepinas, Anfetaminas y derivados) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS
Eicosanoides (Ac. Grasos Poli-insaturados) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo

MUESTRAS DE AGUA (EDAR, RIO, RIEGO)

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Contaminación Fármacos Emergentes Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS
Drogas de Abuso Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS

ANÁLISIS METABOLÓMICO "NO DIRIGIDO" DE MUESTRAS BIOLÓGICAS Y EXTRACTOS VEGETALES

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Estudios de Metabolómica “no dirigida” Extracción de los datos crudos (Cromatogramas LC-MS) UPLC-QToF-MS/MS (F.Scan y AutoMS/MS)

ANÁLISIS MEDIANTE 1H-RMN (EXTRACTOS VEGETALES, ALIMENTOS Y MUESTRAS BIOLÓGICAS)

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Azúcares Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Ácidos Orgánicos Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Aminoácidos y derivados Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Nucleótidos/Nucleósidos Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Polialcoholes (Myo-inositol, Galactitol, Sorbitol, Glicerol) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Metabolitos secundarios (Consultar) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Osmolitos (Betaina, Colina, Sarcosina, EA, DMA) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Lignanos (SDG) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO

Actualizando la tabla de tarifas del Servicio de Metabolómica para el próximo curso 2016/2017.
Si desea solicitar algún presupuesto ajustado a sus necesidades, póngase en contacto con nosotros por correo electrónico: metabolomica@cebas.csic.es

 

 

 

 

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