Description of the Service

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The Metabolomics Platform is an investigation unit in metabolomics created to offer services to different groups of investigation of CEBAS-CSIC and other public or private institutions which pretend deal with this kind of studies.

The Metabolomics Platform intends to offer a service and also participate actively in developing projects and experiments related to metabolomics proposed by the groups. That means that the collaboration must be as close as possible throughout every phase of the project (from the definition of the objectives to the processing and interpretation of the data) helping to obtain satisfactory, substantial and useful for the groups.


Plataforma Metabolómica de Alimentos Vegetales
Unión Europea. Proyecto cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional

The recent acquisition of the UPLC-QTOF 6550 I-Funnel and the impending incorporation of the equipment HPLC-QTOF-SPE-RMN allow an exploration of every analyte of low molecular weight (metabolites) which appear in different kinds of biofluids (e.g plasma and/or orine) or in human and animal tissues. Metabolics can be defined as the more emerging omic science which permits obtaining a metabolic profile of a complex biological sample through the combination of analytical techniques which generate a great amount of data and its multivariate statistical analysis. Metabolomics it leaves aside traditional and reductionist methods which focus on studying the effect of one component about a biological system.

Metabolomics permits the analysis of a great amount of metabolites in complex matrices such as biofluids and tissues in an automated and efficient manner. This analysis generates a profile of metabolites whose comparison, through multivariate statistical techniques which allow the identification of specific metabolic changes for different phenotypes subject of study. Among others, clinical applications of metabolomics, such as the discovery of biomarkers and consequently the early diagnosis of certain diseases, and how it is applied to the study of candidate molecules in the preclinical phase or the use of this technique in trials assessing the terapeutical efficacy.

The work plan for investigation in metabolomics, led or not, can be carried out through multiple techniques available in the Metabolomics Platform of the CEBAS-CSIC.

PERSONAL DEL SERVICIO DE METABOLÓMICA
Frutos Lisón, Mª Dolores Contrato PTA Ext -445326 mdfrutos@cebas.csic.es
Toledo Gil, Rosa Contratada Proyecto Ext -445326 rtoledo@cebas.csic.es
Vallejo Mellado, Fernando Scientific Coordinator
Ext - 445374
metabolomica@cebas.csic.es fvallejo@cebas.csic.es
Yuste Jiménez, José E. Titulado Superior Espec
Ext -445326
jyuste@cebas.csic.es

MUESTRAS ALIMENTARIAS

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Vitamina C (Ac. Ascórbico) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Vitamina E y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Compuestos fenólicos Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Taurina Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Amigdalina y Prunasina Identificación y Cuantificación UPLC-UV-QToF
Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Se-(metil)-seleno-L-Cisteina (SeMC) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Alicina y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Oleuropeína Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Azúcares y ácidos orgánicos Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Compuestos Orgánicos Volátiles (VOCs) Identificación y Cuantificación HS-GC-MS

EXTRACTOS VEGETALES

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Glucosinolatos (Alifáticos/Indólicos) (Consultar) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Compuestos Fenólicos Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Vitamina C (Ac. Ascórbico) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Vitamina E y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Amigdalina y Prunasina Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Alcaloides (Consultar) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Glicoalcaloides (Consultar) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Hormonas vegetales (IAA, SA, ABA, JA y GA3) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Lactonas Sesquiterpénicas Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Micotoxinas (Consultar) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Polialcoholes (Sorbitol, Galactinol, myo-Inositol) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Azucares, ácidos orgánicos y nucleósidos Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Metabolítos Secundarios (consultar) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Trans-Resveratrol Identificación y Cuantificación UPLC-UV-QToF
Compuestos Orgánicos Volátiles (VOCs) Identificación y Cuantificación HS-GC-MS

MUESTRAS BIOLÓGICAS (Plasma, Orina, cultivos "in vitro")

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Vitamina C (Ac. Ascórbico) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Vitamina B y derivados Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Taurina Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Prostaglandinas (PGs) Consultar Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Micotoxinas (Consultar) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Lactulosa/Manitol Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Farmacología (Benzodiacepinas, Anfetaminas, Cannabinoides y derivados) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Eicosanoides (Ac. Grasos Poli-insaturados) Consultar Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Aminas Biogénicas (Consultar) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Ácidos Biliares (A consultar) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Ácidos Grasos de cadena corta (SCFA) Identificación y Cuantificación GC-MS

MUESTRAS DE AGUA (EDAR, RIO, RIEGO)

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Contaminación Fármacos Emergentes Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Drogas de Abuso Identificación y Cuantificación UPLC-QToF

ANÁLISIS METABOLÓMICO "NO DIRIGIDO" DE MUESTRAS BIOLÓGICAS Y EXTRACTOS VEGETALES

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Estudios de Metabolómica “no dirigida” (Consultar) Extracción de los datos crudos (Cromatogramas LC-MS) UPLC-QToF (F.Scan y AutoMS/MS)

ANÁLISIS DE ESPECTROSCOPÍA MEDIANTE 1H-RMN (EXTRACTOS VEGETALES, ALIMENTOS Y MUESTRAS BIOLÓGICAS)

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Azúcares Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Ácidos Orgánicos Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Aminoácidos esenciales y derivados Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Nucleótidos y derivados Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Polialcoholes (Myo-inositol, Galactitol, Sorbitol, Glicerol) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Metabolitos secundarios (Consultar) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Osmolitos (Betaina, Colina, Sarcosina, EA, DMA) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Lignanos (SDG) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Hesperidina (Análisis del isómero S) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO

 

TARIFAS DEL SERVICIO DE METABOLÓMICA DEL CEBAS-CSIC
PLATAFORMAS ANALÍTICAS CEBAS CENTROS CSIC OOPP OTROS (EMPRESAS)
UPLC-UV-QToF-MS (Agilet 6550 y maXis impact series de Bruker) 40 46.92 60 120
UPLC-Triple Quadrupolo (Agilent 6460) 40 46.92 60 120
UPLC-DAD-MS-Quadrupolo simple (Agilent) 30 35.19 46 100
GC‐MS (GC‐8890 y MSD‐5977B Agilent) + Brazo de Gerstel 40 46.92 60 120
RMN AVANCE III HD 500 MHz CryoProbe Prodigy BBO (Bruker) 40 46.91 65 120
UPLC-UV-QToF-MS-SPE-NMR 'On-line' (Bruker) 60 70.38 100 200

- Tarifas por muestra (Precio en euros)
- El precio no incluye la preparación de la muestra
- Precios sin IVA

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