Descripción del Servicio

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La Plataforma de Metabolómica es un servicio de investigación en metabolómica creado para ofrecer apoyo científico-técnico a las tres áreas relacionadas (Ciencias Agrarias, Ciencia y Tecnología de los Alimentos, y Recursos Naturales).del CEBAS-CSIC y a otras instituciones públicas o privadas que pretendan abordar estudios de este tipo.

La Plataforma de Metabolómica pretende, además de ofrecer servicio, colaborar de manera activa en el desarrollo de proyectos y experimentos relacionados con la metabolómica que los grupos propongan. Ello significa que la colaboración debe ser lo más estrecha posible a lo largo de todas las fases del proyecto (desde la definición de los objetivos, hasta el procesado e interpretación de los datos) ayudando así a obtener resultados satisfactorios, significativos y útiles a los grupos.


Plataforma Metabolómica de Alimentos Vegetales
Unión Europea. Proyecto cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional

La metabolómica permite analizar una gran cantidad de metabolitos en matrices complejas como biofluidos y tejidos de manera automatizada y relativamente rápida. Este análisis genera un perfil de metabolitos cuya comparación, por medio de técnicas estadísticas multivariantes, permite identificar cambios metabólicos específicos para los distintos fenotipos objeto de estudio. Entre otras cabe destacar las aplicaciones clínicas de la metabolómica, como por ejemplo el descubrimiento de biomarcadores y con ello la diagnosis prematura de ciertas enfermedades; su aplicación al estudio de moléculas candidatas en fase preclínica o el uso de dicha técnica en ensayos sobre eficacia terapéutica.

La reciente instalación de la “Plataforma de Espectrometría de Masas de Ultra Alta Resolución y Resonancia Magnética Nuclear integradas a través de Extracción en Fase Solida en línea (LC-MS_SPE_RMN) (CSIC10-2E-860) - Bruker” cofinanciada con fondos FEDER única a nivel nacional y especialmente diseñada para su uso en metabolómica. Esta plataforma permite realizar la exploración de todos los analitos de bajo peso molecular (metabolitos) presentes en distintos tipos de biofluidos (ej. plasma y/o orina) o en tejidos tanto de humanos como de modelos animales y la elucidación estructural inequívoca de metabolitos capturados selectivamente. Además, la plataforma posee otros equipos de última generación ya presentes en el CEBAS-CSIC, como son el HPLC 1200-DAD-ESI-MSn (HTC Bruker), UPLC-MS-Quadrupolo simple (Agilent), UPLC-Triple Quadrupolo (6460 Agilent) y UPLC-QTOF (6550 Agilent).

El diagrama de trabajo para la investigación en Metabolómica, sea Dirigida o No Dirigida, puede ser llevado a cabo a través de las últimas actualizaciones disponibles de los dos principales software de post-procesado de datos (Mass Profiler Professional-Agilent y Hystar-Bruker) en la Plataforma de Metabolómica del CEBAS-CSIC.

PERSONAL DEL SERVICIO DE METABOLÓMICA
Frutos Lisón, Mª Dolores Contrato PTA Ext - 445326 mdfrutos@cebas.csic.es
Toledo Gil, Rosa Contratada Proyecto Ext -445326 rtoledo@cebas.csic.es
Vallejo Mellado, Fernando Coordinador Científico
Ext - 445374
metabolomica@cebas.csic.es fvallejo@cebas.csic.es
Yuste Jiménez, José E. Titulado Superior Espec
Ext - 445326
jyuste@cebas.csic.es

MUESTRAS ALIMENTARIAS

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Vitamina C (Ac. Ascórbico) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Vitamina E y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Compuestos fenólicos Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Taurina Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Amigdalina y Prunasina Identificación y Cuantificación UPLC-UV-QToF
Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Se-(metil)-seleno-L-Cisteina (SeMC) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Alicina y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Oleuropeína Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Azúcares y ácidos orgánicos Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Compuestos Orgánicos Volátiles (VOCs) Identificación y Cuantificación HS-GC-MS

EXTRACTOS VEGETALES

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Glucosinolatos (Alifáticos/Indólicos) (Consultar) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Compuestos Fenólicos Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Vitamina C (Ac. Ascórbico) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Vitamina E y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Amigdalina y Prunasina Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Alcaloides (Consultar) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Glicoalcaloides (Consultar) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Hormonas vegetales (IAA, SA, ABA, JA y GA3) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Lactonas Sesquiterpénicas Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Micotoxinas (Consultar) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Polialcoholes (Sorbitol, Galactinol, myo-Inositol) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Azucares, ácidos orgánicos y nucleósidos Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Metabolítos Secundarios (consultar) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Trans-Resveratrol Identificación y Cuantificación UPLC-UV-QToF
Compuestos Orgánicos Volátiles (VOCs) Identificación y Cuantificación HS-GC-MS

MUESTRAS BIOLÓGICAS (Plasma, Orina, cultivos "in vitro")

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Vitamina C (Ac. Ascórbico) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Vitamina B y derivados Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Taurina Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Prostaglandinas (PGs) Consultar Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Micotoxinas (Consultar) Identificación y Cuantificación UPLC- QToF
Lactulosa/Manitol Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Farmacología (Benzodiacepinas, Anfetaminas, Cannabinoides y derivados) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Eicosanoides (Ac. Grasos Poli-insaturados) Consultar Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Aminas Biogénicas (Consultar) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Ácidos Biliares (A consultar) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Ácidos Grasos de cadena corta (SCFA) Identificación y Cuantificación GC-MS

MUESTRAS DE AGUA (EDAR, RIO, RIEGO)

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Contaminación Fármacos Emergentes Identificación y Cuantificación UPLC-QToF
Drogas de Abuso Identificación y Cuantificación UPLC-QToF

ANÁLISIS METABOLÓMICO "NO DIRIGIDO" DE MUESTRAS BIOLÓGICAS Y EXTRACTOS VEGETALES

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Estudios de Metabolómica “no dirigida” (Consultar) Extracción de los datos crudos (Cromatogramas LC-MS) UPLC-QToF (F.Scan y AutoMS/MS)

ANÁLISIS DE ESPECTROSCOPÍA MEDIANTE 1H-RMN (EXTRACTOS VEGETALES, ALIMENTOS Y MUESTRAS BIOLÓGICAS)

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Azúcares Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Ácidos Orgánicos Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Aminoácidos esenciales y derivados Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Nucleótidos y derivados Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Polialcoholes (Myo-inositol, Galactitol, Sorbitol, Glicerol) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Metabolitos secundarios (Consultar) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Osmolitos (Betaina, Colina, Sarcosina, EA, DMA) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Lignanos (SDG) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Hesperidina (Análisis del isómero S) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO

 

TARIFAS DEL SERVICIO DE METABOLÓMICA DEL CEBAS-CSIC
PLATAFORMAS ANALÍTICAS CEBAS CENTROS CSIC OOPP OTROS (EMPRESAS)
UPLC-UV-QToF-MS (Agilet 6550 y maXis impact series de Bruker) 40 46.92 60 120
UPLC-Triple Quadrupolo (Agilent 6460) 40 46.92 60 120
UPLC-DAD-MS-Quadrupolo simple (Agilent) 30 35.19 46 100
GC‐MS (GC‐8890 y MSD‐5977B Agilent) + Brazo de Gerstel 40 46.92 60 120
RMN AVANCE III HD 500 MHz CryoProbe Prodigy BBO (Bruker) 40 46.91 65 120
UPLC-UV-QToF-MS-SPE-NMR 'On-line' (Bruker) 60 70.38 100 200

- Tarifas por muestra (Precio en euros)
- El precio no incluye la preparación de la muestra
- Precios sin IVA

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