Toda la actividad investigadora que se desarrolla en el CEBAS-CSIC se sustenta en conocimientos e investigación fundamental pero con una clara orientación hacia su aplicación práctica. Para facilitar el aprovechamiento de estos conocimientos por parte de los sectores productivos cuenta con su Oficina de Transferencia de Tecnología (OTT) cuya misión es promover, coordinar y gestionar las relaciones entre los grupos de investigación del CEBAS-CSIC y las empresas.

La OTT facilita la incorporación a la sociedad del conocimiento generado por los científicos del CEBAS-CSIC y los resultados de sus investigaciones, para ello promueve y facilita la relación con las empresas canalizando sus demandas hacia los científicos. Promociona y difunde los resultados de la actividad científica, asesora a las empresas que contratan con el CEBAS-CSIC y orienta sobre el acceso a financiación pública en I+D+i. Asimismo, participa en la elaboración, tramitación y gestión de solicitudes de ayudas a las convocatorias públicas de cooperación entre empresas e investigadores del CEBAS-CSIC. Además, realiza la gestión de patentes y protección de resultados y comercializa dichos resultados. La OTT también asesora a los científicos del CEBAS-CSIC en la creación de empresas de base tecnológica.